Clinoptilolitul intruneste urmatoarele proprietati

Este un mineral rar, incarcat negativ, proprietate unica in regnul sau;
Are capacitatea unica de a atrage metalele grele si materialele radioactive;
Are o structura rigida, tridimensionala, cristalina (similar cu un fagure de miere), constand dintr-o retea de tuneluri interconectate si custi, prin care apa se misca liber inauntru si in afara acestor pori, structura ramanand rigida;
Dimensiunile porilor si canalelor sale sunt aproape uniforme, permitand cristalului sa acţioneze ca o sita moleculara;
Este gazda pentru moleculele de apa si ionii de potasiu si calciu, precum si o varietate de alti ioni incarcati pozitiv, dar numai pentru cele de dimensiuni moleculare adecvate care se potrivesc in porii cristalului, creand proprietatea de „sita”;
Are capacitatea de schimb cationic ridicata;
Are capacitate mare de absorbtie si desorbtie;
Este un bun catalizator;